111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3495 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  100 
 
 		 356 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  46.86 
 
 		 352 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  40.11 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  40.96 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  40.96 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  40.25 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  40.72 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  40.66 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  40.66 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  40.66 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  40.66 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  40.66 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  40.12 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  40.12 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  40.12 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  40.36 
 
 		 353 aa  242  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  39.82 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  39.82 
 
 		 353 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  35.05 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  34.68 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  32.66 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  27.57 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  23.6 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  24.38 
 
 		 451 aa  82.8  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.21 
 
 		 752 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  23.31 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  23.72 
 
 		 1094 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  24.29 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.97 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2566  hypothetical protein  23.95 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0965859  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.47 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.28 
 
 		 819 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.81 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1056 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.71 
 
 		 943 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1667 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.78 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.52 
 
 		 660 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  26.34 
 
 		 640 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.58 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  23.44 
 
 		 660 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.56 
 
 		 457 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.17 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.86 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  27.86 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.2 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  23.08 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.77 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.32 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.84 
 
 		 607 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  20.86 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  17.07 
 
 		 479 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.16 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1189 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.93 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.57 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.81 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  22.84 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  19.83 
 
 		 517 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.23 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4179  hypothetical protein  22.41 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4245  hypothetical protein  22.41 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203557  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  20.39 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4401  hypothetical protein  22.41 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.3 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.25 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.47 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.15 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  19.76 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  20.89 
 
 		 580 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.41 
 
 		 829 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  22.65 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.5 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.85 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.24 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2448  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.4 
 
 		 658 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  23.67 
 
 		 679 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.92 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.05 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2282  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.88 
 
 		 658 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.512242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.97 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.05 
 
 		 776 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.67 
 
 		 818 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.98 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  21.83 
 
 		 971 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  22.04 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  22.04 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  31.87 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.81 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.08 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.08 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.8 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  19.56 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.55 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.55 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.55 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>