91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3318 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  88.2 
 
 		 216 aa  314  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  88.2 
 
 		 216 aa  313  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  81.36 
 
 		 184 aa  305  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  85.56 
 
 		 203 aa  300  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  86.93 
 
 		 182 aa  296  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  86.93 
 
 		 182 aa  296  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  86.93 
 
 		 182 aa  296  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  86.13 
 
 		 201 aa  295  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  84.57 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  84.57 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  84.57 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  84.57 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  84.57 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  83.83 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  43.83 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  44.44 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  39.41 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  34.81 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  32.73 
 
 		 459 aa  89.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 178 aa  87.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  33.59 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.67 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.52 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  34.45 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.81 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  27.39 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  28.86 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.8 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  24.84 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  26.67 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.75 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  28.25 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.03 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.55 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  30.58 
 
 		 255 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.89 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.66 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  31.71 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.35 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.56 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.74 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.23 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  24.85 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1019  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.67 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2765  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>