More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3245 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1092    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  52.08 
 
 		 526 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  52.08 
 
 		 526 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  45.67 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  45.67 
 
 		 518 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  48.58 
 
 		 497 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  42.41 
 
 		 518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  42.41 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  42.41 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  42.41 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  42.41 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  42.52 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  33.9 
 
 		 521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  44.75 
 
 		 523 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  32.66 
 
 		 516 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.7 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.33 
 
 		 516 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.7 
 
 		 516 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  31.29 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  31.61 
 
 		 528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.56 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  30.86 
 
 		 538 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  30.32 
 
 		 534 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  32.11 
 
 		 528 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  30.8 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  31.67 
 
 		 528 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  33.63 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  29.68 
 
 		 521 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  29.01 
 
 		 507 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  29.01 
 
 		 507 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.17 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.98 
 
 		 521 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  29.45 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  29.45 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 521 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.45 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  29.45 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.45 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  30.68 
 
 		 520 aa  210  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  29.39 
 
 		 532 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  30.87 
 
 		 526 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.39 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  31.45 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  32.14 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.02 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.02 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.81 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  31.01 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  39.77 
 
 		 511 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  29.55 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.79 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  30.6 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.25 
 
 		 474 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  30.12 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  30.5 
 
 		 506 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  30.06 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  29.72 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  40.65 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  31.69 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.45 
 
 		 362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 362 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  40.23 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 362 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.08 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  40.08 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  40.08 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  41.03 
 
 		 525 aa  188  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  40.08 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  29.57 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3494  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.73 
 
 		 729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.48 
 
 		 911 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2357  sensory box/GGDEF family protein  39.61 
 
 		 912 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2533  sensory box/GGDEF family protein  39.61 
 
 		 912 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0427  sensory box protein  38.91 
 
 		 1491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2548  sensory box/GGDEF family protein  39.61 
 
 		 828 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19879e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.8 
 
 		 965 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  38.1 
 
 		 794 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.65 
 
 		 1494 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2314  sensory box/GGDEF family protein  39.61 
 
 		 912 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.6229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.65 
 
 		 1466 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1691  sensory box/GGDEF family protein  39.68 
 
 		 838 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000833802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0782  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.9 
 
 		 736 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0957  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.87 
 
 		 633 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.45 
 
 		 1487 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  28.92 
 
 		 588 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2016  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.29 
 
 		 874 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  34.1 
 
 		 532 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.8 
 
 		 897 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000208588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.11 
 
 		 568 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00246734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2963  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.5 
 
 		 1251 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3284  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.4 
 
 		 645 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3630  sensory box/GGDEF family protein  39.92 
 
 		 828 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.931883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2272  sensory box/GGDEF family protein  39.22 
 
 		 912 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>