More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3231 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  66.41 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  66.41 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  65.62 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  42.86 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  42.02 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  38.33 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  43.59 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  42.74 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  40.87 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  33.33 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  36.61 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  36.22 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  33.02 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.62 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  31.62 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  30.43 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  31.03 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  31.03 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  35.07 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.06 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.4 
 
 		 360 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0863  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  28.46 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  28.46 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  28.46 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  27.97 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 		 525 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.3 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.44 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  29.6 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  26.52 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.08 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  27.83 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.8 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.6 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3846  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.81 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>