More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3154 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  70.15 
 
 
565 aa  744    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  64.61 
 
 
563 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  71.01 
 
 
561 aa  753    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  67.93 
 
 
558 aa  726    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  67.89 
 
 
546 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.49 
 
 
546 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  62.73 
 
 
547 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  100 
 
 
557 aa  1105    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  56.8 
 
 
583 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  54.73 
 
 
536 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  54.45 
 
 
575 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.39 
 
 
661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  49.54 
 
 
573 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  51.12 
 
 
541 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  49.37 
 
 
571 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  48.92 
 
 
594 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  52.29 
 
 
551 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
573 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.09 
 
 
572 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  48.57 
 
 
588 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  48.12 
 
 
619 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.98 
 
 
643 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  48.38 
 
 
597 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.49 
 
 
578 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  47.55 
 
 
597 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  50.55 
 
 
565 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  49.91 
 
 
548 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 
539 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.72 
 
 
548 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  50.37 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  50.94 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  49.35 
 
 
545 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  48.81 
 
 
538 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.88 
 
 
584 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  48.59 
 
 
547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.27 
 
 
564 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.32 
 
 
534 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.12 
 
 
549 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  46.8 
 
 
534 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  47.1 
 
 
535 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  48.31 
 
 
528 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  43.41 
 
 
564 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  46.79 
 
 
532 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  45.37 
 
 
550 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  44.59 
 
 
585 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.86 
 
 
555 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  43.47 
 
 
540 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.11 
 
 
531 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.23 
 
 
586 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  43.49 
 
 
545 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  44.4 
 
 
553 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.04 
 
 
619 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  43.93 
 
 
547 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  43.39 
 
 
576 aa  423  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.68 
 
 
609 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  43.02 
 
 
571 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  43.21 
 
 
569 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  41.61 
 
 
547 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
540 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  43.49 
 
 
546 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  42.99 
 
 
555 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.32 
 
 
613 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  39.81 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  44.3 
 
 
539 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.41 
 
 
549 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  50.61 
 
 
505 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  45.27 
 
 
552 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  42.99 
 
 
552 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.42 
 
 
588 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  41.16 
 
 
606 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.1 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.66 
 
 
568 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  43.93 
 
 
539 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  45.95 
 
 
606 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  43.69 
 
 
556 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  45.27 
 
 
552 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  44.49 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  44.13 
 
 
592 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  41.35 
 
 
562 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  42.94 
 
 
545 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 
544 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  43.76 
 
 
543 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  40.65 
 
 
615 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
619 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  43.4 
 
 
548 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  43.76 
 
 
543 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  41.65 
 
 
612 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.4 
 
 
571 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  43.76 
 
 
543 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  43.15 
 
 
550 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  40.18 
 
 
611 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  44.94 
 
 
600 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  43.45 
 
 
557 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.46 
 
 
617 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.01 
 
 
590 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.93 
 
 
531 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  43.63 
 
 
557 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  42.5 
 
 
558 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  43.58 
 
 
592 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  44.51 
 
 
539 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>