More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3116 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 741 aa  1458    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  75.98 
 
 		 741 aa  1104    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  75.61 
 
 		 741 aa  1098    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.1 
 
 		 740 aa  1043    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.31 
 
 		 741 aa  1110    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.76 
 
 		 742 aa  1041    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.17 
 
 		 758 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.85 
 
 		 743 aa  1057    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 		 728 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.73 
 
 		 615 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 		 692 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 		 692 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.04 
 
 		 700 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 692 aa  489  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  44.2 
 
 		 685 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 738 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 		 563 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 569 aa  336  7.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 569 aa  334  4e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.09 
 
 		 579 aa  323  9.000000000000001e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 		 543 aa  271  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 		 545 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  31.88 
 
 		 568 aa  207  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  26.03 
 
 		 564 aa  196  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 677 aa  195  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 		 585 aa  184  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.11 
 
 		 551 aa  181  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 574 aa  177  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  29.29 
 
 		 583 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  28.92 
 
 		 552 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.92 
 
 		 545 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 		 563 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 		 585 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  29.21 
 
 		 574 aa  174  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  28.92 
 
 		 583 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 		 585 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  28.92 
 
 		 583 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 		 603 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 		 579 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 		 576 aa  170  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  27.33 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 585 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  28.9 
 
 		 574 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  28.73 
 
 		 592 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 		 551 aa  167  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.26 
 
 		 580 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.52 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.52 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.83 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 572 aa  161  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 		 545 aa  160  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.92 
 
 		 592 aa  160  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  27.16 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 		 550 aa  157  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.31 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.07 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 		 574 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 		 568 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 		 570 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.13 
 
 		 554 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 		 608 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.57 
 
 		 574 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.07 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 559 aa  146  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 551 aa  144  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.89 
 
 		 580 aa  142  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 		 561 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.44 
 
 		 544 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 		 564 aa  134  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.44 
 
 		 587 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 		 547 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.77 
 
 		 600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 602 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 		 732 aa  124  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  24.28 
 
 		 556 aa  124  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  24.08 
 
 		 556 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 		 600 aa  120  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 		 608 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  23.22 
 
 		 575 aa  117  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 		 556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  25.22 
 
 		 572 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 592 aa  111  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 		 616 aa  111  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.28 
 
 		 556 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.62 
 
 		 606 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.51 
 
 		 609 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.2 
 
 		 561 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  24.42 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>