More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3108 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  70.18 
 
 
231 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  69.74 
 
 
231 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  70.74 
 
 
231 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  73.53 
 
 
231 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  56.28 
 
 
203 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  55.28 
 
 
203 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  55.78 
 
 
211 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  55.78 
 
 
211 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  54.82 
 
 
216 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  55.28 
 
 
203 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
234 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  48.73 
 
 
289 aa  198  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  47.42 
 
 
244 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 
207 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  40.8 
 
 
218 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 
201 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  40.82 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 
181 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
342 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  42.02 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  38.76 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  37.57 
 
 
198 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  36.31 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.77 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
199 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  40.74 
 
 
198 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 
196 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
199 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 
196 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  34.08 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  34.08 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.52 
 
 
187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  33.52 
 
 
187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  35.26 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  34.08 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  32.96 
 
 
187 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  33.85 
 
 
196 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  37.71 
 
 
201 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  37.29 
 
 
181 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
181 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
221 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
221 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
181 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
185 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
193 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
182 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 
187 aa  105  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 
196 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
193 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
181 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
203 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
210 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
221 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  34.63 
 
 
248 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
210 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 
196 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
202 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 
217 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 
180 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  34.57 
 
 
176 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 
199 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.71 
 
 
176 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.93 
 
 
176 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.46 
 
 
182 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
184 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  33.33 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
182 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  41.26 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.07 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  35.19 
 
 
359 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  38.62 
 
 
182 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  33.95 
 
 
176 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  33.95 
 
 
176 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  33.95 
 
 
176 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  34.57 
 
 
359 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
190 aa  95.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  31.52 
 
 
185 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  37.67 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  36 
 
 
185 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.07 
 
 
185 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>