More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3077 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.04 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  63.04 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  63.04 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  62.65 
 
 
255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.04 
 
 
261 aa  278  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  58.09 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  58.51 
 
 
257 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  58.09 
 
 
257 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  48.22 
 
 
275 aa  241  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  54.09 
 
 
257 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  47.62 
 
 
257 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
257 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  46.47 
 
 
257 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  42.58 
 
 
258 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 
258 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  45.42 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
258 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
258 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.43 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
257 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.58 
 
 
256 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
259 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
257 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
257 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
261 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
257 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
258 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
261 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
257 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
257 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  46.47 
 
 
257 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  41.91 
 
 
269 aa  207  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
258 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
257 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
257 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
259 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 
256 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
257 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.36 
 
 
255 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
253 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.37 
 
 
255 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
259 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 
258 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 
258 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
259 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
259 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
262 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  44.35 
 
 
258 aa  202  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 
263 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
259 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.55 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
254 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
265 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 
262 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
259 aa  198  9e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.98 
 
 
258 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.83 
 
 
266 aa  195  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
258 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
259 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
259 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
258 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.62 
 
 
258 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
258 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
257 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
254 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  42.98 
 
 
251 aa  193  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
253 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
257 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
257 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
258 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
258 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
256 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
258 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
258 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 
258 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
256 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
258 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
258 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.02 
 
 
257 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
259 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2905  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 
256 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.433912  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
258 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
258 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>