72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3010 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  63.04 
 
 		 191 aa  250  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.43 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  46.91 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.94 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  40.8 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.24 
 
 		 171 aa  140  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  39.62 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  41.82 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  40.85 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  41.61 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  41.61 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  41.61 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  41.61 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  41.61 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  41.61 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  46.5 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  45.68 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.51 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.36 
 
 		 183 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  39.63 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  39.26 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.81 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  37.01 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.13 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  37.58 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  34.39 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.03 
 
 		 164 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.03 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.03 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  35.03 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  29.19 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.77 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.67 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.87 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.43 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  34.04 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  34.04 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.25 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  34.02 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.35 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.68 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.37 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  35.64 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.37 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  31.37 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  31.37 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  31.37 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.37 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  27.22 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  30.49 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>