126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3005 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  326  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  78.75 
 
 
160 aa  250  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  67.5 
 
 
160 aa  238  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  68.75 
 
 
160 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  68.75 
 
 
160 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  67.92 
 
 
160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  58.64 
 
 
163 aa  203  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  58.02 
 
 
163 aa  202  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  57.41 
 
 
163 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  43.75 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  42.5 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  42.5 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  42.5 
 
 
160 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  42.77 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  41.88 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  42.5 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  44.38 
 
 
160 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  39.38 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  38.75 
 
 
161 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  38.75 
 
 
161 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  39.38 
 
 
161 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  39.38 
 
 
161 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  38.75 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  45.62 
 
 
160 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  44.72 
 
 
161 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  41.25 
 
 
160 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  38.12 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  43.67 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  41.25 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.75 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  42.24 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  41.61 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  47.17 
 
 
162 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  42.24 
 
 
161 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  46.91 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  46.91 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  39.88 
 
 
161 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  38.51 
 
 
161 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  38.51 
 
 
161 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  38.51 
 
 
161 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  38.51 
 
 
161 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  38.51 
 
 
161 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  38.51 
 
 
161 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  41.4 
 
 
158 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  38.12 
 
 
161 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  37.58 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  36.88 
 
 
189 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  36.88 
 
 
161 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  36.88 
 
 
161 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  34.93 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.93 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.93 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  40.13 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  32.69 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  32.89 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  33.76 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  30.18 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  35.57 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  30.18 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.18 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.18 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.54 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  30.41 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  33.53 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  37.17 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  29.82 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  29.38 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  26.25 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  31.85 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  30.71 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  28.48 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  30.87 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.12 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  25.15 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.93 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  23.46 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  24.54 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.93 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  22.84 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.38 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  26.22 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  26.22 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  26.22 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>