More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2967 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
407 aa  820    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  66.12 
 
 
428 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  66.12 
 
 
428 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  66.12 
 
 
428 aa  554  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  65.29 
 
 
403 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  65.29 
 
 
403 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  64.08 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  64.73 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  64.32 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  64.73 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  64.73 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  64.39 
 
 
402 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  64.39 
 
 
402 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  63.83 
 
 
401 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  64.15 
 
 
402 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  63.83 
 
 
401 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  63.9 
 
 
402 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  64.1 
 
 
404 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  57.66 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  58.05 
 
 
405 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  56.69 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  56.83 
 
 
399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  48.32 
 
 
404 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  47.17 
 
 
383 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01080  hypothetical protein  71.76 
 
 
219 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  45.69 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  45.79 
 
 
415 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  43.65 
 
 
417 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  45.39 
 
 
410 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  43.3 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  44.15 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  44.15 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  44.15 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  44.29 
 
 
413 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  43.57 
 
 
414 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  43.54 
 
 
413 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
413 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  43.3 
 
 
413 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  43.3 
 
 
413 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  43.44 
 
 
414 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  42.22 
 
 
442 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  43.06 
 
 
413 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 
413 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  41.81 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  42.82 
 
 
425 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  41.87 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  43.57 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  43.17 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  43.57 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  42.52 
 
 
401 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  42.15 
 
 
423 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  39.34 
 
 
408 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  42.2 
 
 
387 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  39.44 
 
 
420 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  41.07 
 
 
426 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  40.44 
 
 
399 aa  259  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  40.49 
 
 
402 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  40.89 
 
 
395 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  41.13 
 
 
395 aa  255  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.18 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  40.19 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.95 
 
 
400 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  36.03 
 
 
450 aa  252  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  37.61 
 
 
441 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.44 
 
 
430 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 
398 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.16 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 
442 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  39 
 
 
407 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.13 
 
 
428 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.32 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  35.62 
 
 
462 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  39.86 
 
 
404 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  39.81 
 
 
398 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  37.04 
 
 
425 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  36.65 
 
 
438 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  38.88 
 
 
402 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  39.05 
 
 
402 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  36.94 
 
 
437 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  37.25 
 
 
440 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  36.71 
 
 
437 aa  235  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.95 
 
 
395 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  35.79 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  36.73 
 
 
407 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  36.73 
 
 
407 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  37.59 
 
 
395 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  37.17 
 
 
395 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  36.16 
 
 
440 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 
413 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  36.3 
 
 
408 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  36.32 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.65 
 
 
413 aa  226  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>