146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2892 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 429 aa  848    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  36.61 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  29.37 
 
 		 440 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  30.55 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 		 440 aa  156  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.9 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  28.94 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 476 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4207  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00266621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  22.52 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.54 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.98 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  25.07 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  29.32 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  26.16 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.73 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  22.8 
 
 		 506 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  26.6 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  20.63 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  27.84 
 
 		 488 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  22.5 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  23.74 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.28 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  21.94 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  23.23 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  25.86 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  26.42 
 
 		 464 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 541 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 533 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  22.12 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>