29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2891 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  41.48 
 
 
338 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  38.52 
 
 
343 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  37.5 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  37.32 
 
 
345 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  34.08 
 
 
286 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  35.07 
 
 
301 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  33.21 
 
 
296 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  33.82 
 
 
295 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  32.71 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  32.08 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  32.71 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  30.48 
 
 
299 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  29.35 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  28.11 
 
 
304 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  29.5 
 
 
281 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  29.72 
 
 
260 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  29.73 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  25.88 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  24.29 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  24.57 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  24.14 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  24.14 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  24.14 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  24.14 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  24.14 
 
 
239 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  24.14 
 
 
259 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  24.21 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>