More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2888 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
247 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  48.99 
 
 
260 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
244 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  36.95 
 
 
249 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
249 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
249 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.8 
 
 
251 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.96 
 
 
266 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  33.74 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
266 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.8 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
302 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
1250 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  49.51 
 
 
310 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
344 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
386 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
338 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
351 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
321 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
327 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
347 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
299 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
337 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
326 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
373 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
318 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
380 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
398 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
663 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.44 
 
 
326 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
230 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.72 
 
 
321 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
323 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.16 
 
 
326 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  46 
 
 
374 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
303 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.09 
 
 
295 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
333 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
337 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  43.69 
 
 
1035 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
308 aa  98.6  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
307 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  50.96 
 
 
597 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.88 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.88 
 
 
326 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
581 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 
379 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.28 
 
 
328 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
348 aa  95.9  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  47.62 
 
 
362 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
390 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
324 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
345 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  44.34 
 
 
327 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
397 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1691  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
273 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
320 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  39.86 
 
 
146 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
316 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
319 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 
334 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
325 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
315 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
343 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
1177 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
309 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
322 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
1177 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  44.66 
 
 
333 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  36.88 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>