More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2820 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  71.79 
 
 
279 aa  410  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  71.79 
 
 
279 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  71.79 
 
 
279 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  66.3 
 
 
276 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  65.93 
 
 
276 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  63.7 
 
 
269 aa  351  8e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  63.7 
 
 
269 aa  351  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  63.7 
 
 
269 aa  351  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  63.33 
 
 
269 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  63.7 
 
 
269 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  63.33 
 
 
269 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  63.33 
 
 
269 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  63.33 
 
 
269 aa  349  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  62.96 
 
 
269 aa  348  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  57.41 
 
 
269 aa  342  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  63.57 
 
 
274 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  58.09 
 
 
317 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  62.36 
 
 
270 aa  333  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  56.99 
 
 
275 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  56.62 
 
 
278 aa  325  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  62.22 
 
 
286 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  61.62 
 
 
269 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  61.62 
 
 
269 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  61.25 
 
 
269 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  61.25 
 
 
269 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  61.25 
 
 
269 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  48.34 
 
 
272 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  49.64 
 
 
273 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  49.63 
 
 
271 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  48.89 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  48.93 
 
 
282 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  49.63 
 
 
271 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  49.63 
 
 
271 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  47.41 
 
 
270 aa  262  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  47.04 
 
 
271 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  47.41 
 
 
271 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  47.04 
 
 
271 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  47.23 
 
 
271 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  45.93 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  45.93 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  47.04 
 
 
271 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  46.15 
 
 
268 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  48.89 
 
 
279 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  42.75 
 
 
277 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  40.61 
 
 
282 aa  202  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  36 
 
 
282 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.7 
 
 
269 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.32 
 
 
270 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.7 
 
 
269 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.32 
 
 
270 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  42.51 
 
 
267 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.91 
 
 
270 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  40.49 
 
 
269 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  37.11 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  38.83 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  40.89 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 
294 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  36.53 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.91 
 
 
270 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.24 
 
 
283 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  42.32 
 
 
282 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  40.16 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  39.65 
 
 
294 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.91 
 
 
320 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1081  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.11 
 
 
298 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00250599  normal  0.0321173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  39.02 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1113  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.82 
 
 
285 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0490976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0968  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.66 
 
 
277 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000856039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.08 
 
 
313 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.96 
 
 
280 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.53281  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1162  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.45 
 
 
292 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000132162  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1230  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.96 
 
 
280 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.706376  normal  0.528023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1197  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.96 
 
 
280 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  34.42 
 
 
313 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.94 
 
 
285 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1153  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.47 
 
 
280 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.010967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.81 
 
 
274 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2899  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000719078  hitchhiker  0.00146676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2981  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.45 
 
 
279 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000243248  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3078  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  33.7 
 
 
279 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000214385  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1294  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.61 
 
 
275 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  31 
 
 
274 aa  136  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.86 
 
 
277 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  34.62 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  29.27 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000111117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  30.74 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.89 
 
 
309 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.97 
 
 
277 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
285 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0832  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  27.64 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000147805  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  33.2 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.02 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.51 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  32.65 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1634  putative ribosomal RNA methyltransferase  35 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  30.51 
 
 
302 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>