More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2811 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  100 
 
 
538 aa  1105    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  46.82 
 
 
532 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  45.61 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  45.61 
 
 
533 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  45.61 
 
 
533 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  49.55 
 
 
474 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  43.55 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  43.55 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  43.55 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  49.43 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  43.55 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  43.55 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  43.36 
 
 
532 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  34.48 
 
 
521 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  34.13 
 
 
526 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  32.68 
 
 
518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  32.68 
 
 
518 aa  241  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  32.68 
 
 
518 aa  241  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  32.68 
 
 
518 aa  241  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  32.68 
 
 
518 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  33.46 
 
 
523 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  35.78 
 
 
518 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  35.78 
 
 
518 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  35.78 
 
 
518 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  35.78 
 
 
518 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  35.56 
 
 
518 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  32.47 
 
 
497 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  32.47 
 
 
518 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  32.47 
 
 
518 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  31.47 
 
 
534 aa  236  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  32.53 
 
 
518 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  32.68 
 
 
535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  33.05 
 
 
528 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  32.36 
 
 
511 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  30.92 
 
 
518 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  30.5 
 
 
506 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  33.26 
 
 
519 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  30.89 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  30.8 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  32 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.39 
 
 
516 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  30.38 
 
 
506 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  34.39 
 
 
516 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  32.42 
 
 
528 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.18 
 
 
516 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  34.17 
 
 
516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.97 
 
 
516 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  31.77 
 
 
528 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 
528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  32.81 
 
 
520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  31.58 
 
 
528 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  30.53 
 
 
515 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  32.94 
 
 
501 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  29.94 
 
 
514 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  30.13 
 
 
500 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 
512 aa  200  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.6 
 
 
504 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  31.97 
 
 
507 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  31.76 
 
 
521 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.96 
 
 
521 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  31.97 
 
 
507 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.74 
 
 
521 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  31.96 
 
 
521 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  29.11 
 
 
526 aa  190  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  29.11 
 
 
526 aa  190  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  40.28 
 
 
525 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.63 
 
 
876 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.98 
 
 
1494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.98 
 
 
1466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  42.32 
 
 
1534 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0427  sensory box protein  40.24 
 
 
1491 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.08 
 
 
929 aa  183  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  31.1 
 
 
588 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  37.13 
 
 
538 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.11 
 
 
486 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  28.82 
 
 
489 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.16 
 
 
1487 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.37 
 
 
1497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.996532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.27 
 
 
947 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.37 
 
 
1490 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982948  hitchhiker  0.0000000550616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.37 
 
 
1497 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.48 
 
 
1484 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.978359  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  40.6 
 
 
537 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1976  PAS:GGDEF  39.02 
 
 
963 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0463  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.51 
 
 
689 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.73 
 
 
704 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.98 
 
 
1497 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.31 
 
 
549 aa  178  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  40.93 
 
 
689 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0603  sensory box/GGDEF family protein  39.59 
 
 
702 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0422  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.78 
 
 
1492 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.144881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0624  sensory box/GGDEF family protein  39.59 
 
 
689 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4753  sensory box/GGDEF family protein  39.51 
 
 
689 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.410613  hitchhiker  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 
534 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.23 
 
 
1063 aa  177  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180042  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.76 
 
 
1040 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.36 
 
 
704 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.08 
 
 
576 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0456  sensory box/GGDEF family protein  39.34 
 
 
689 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>