More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2714 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  58.06 
 
 
195 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  58.06 
 
 
195 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  58.06 
 
 
195 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  58.6 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  58.06 
 
 
195 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  58.6 
 
 
195 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  58.6 
 
 
195 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  54.01 
 
 
194 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  53.51 
 
 
193 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  54.3 
 
 
194 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  54.3 
 
 
194 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  54.01 
 
 
194 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  53.51 
 
 
193 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  53.51 
 
 
193 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  52.97 
 
 
193 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  52.69 
 
 
193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  52.15 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  51.61 
 
 
195 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  51.61 
 
 
195 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  51.61 
 
 
195 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  51.61 
 
 
195 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  51.61 
 
 
195 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  51.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  51.34 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  51.08 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  55.08 
 
 
192 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  52.15 
 
 
194 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  53.23 
 
 
193 aa  204  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  51.09 
 
 
201 aa  203  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  52.85 
 
 
199 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  48.39 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  52.15 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  48.13 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  53.3 
 
 
195 aa  197  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  46.19 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  195  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  49.46 
 
 
197 aa  194  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  53.19 
 
 
195 aa  194  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  47.34 
 
 
194 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  51.08 
 
 
194 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  47.85 
 
 
196 aa  193  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  47.34 
 
 
194 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  51.6 
 
 
186 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  47.87 
 
 
194 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  52.41 
 
 
189 aa  191  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  50.57 
 
 
195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  52.3 
 
 
200 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  47.31 
 
 
197 aa  187  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  187  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  53.26 
 
 
196 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  47.03 
 
 
193 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1885  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  41.71 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  48.68 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  51.61 
 
 
193 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  49.21 
 
 
196 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  48.33 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  49.46 
 
 
193 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  51.41 
 
 
185 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  51.69 
 
 
180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  52.15 
 
 
208 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  45.65 
 
 
193 aa  178  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  52.87 
 
 
203 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  51.61 
 
 
193 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  41.18 
 
 
188 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  48.85 
 
 
197 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  44.86 
 
 
204 aa  174  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  49.71 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  41.08 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  41.08 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  49.71 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  45.55 
 
 
206 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  47.73 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5199  decarboxylase family protein  45.74 
 
 
192 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  49.46 
 
 
193 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  47.28 
 
 
207 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  45.74 
 
 
192 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  45.6 
 
 
193 aa  168  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  46.51 
 
 
182 aa  168  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  44.09 
 
 
200 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5209  decarboxylase family protein  45.21 
 
 
192 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0048  decarboxylase family protein  45.21 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  hitchhiker  2.41999e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4781  lysine decarboxylase family protein  44.68 
 
 
192 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  47.28 
 
 
200 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4878  hypothetical protein  44.68 
 
 
192 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000403902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5194  decarboxylase family protein  44.15 
 
 
192 aa  164  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0328593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4917  hypothetical protein  44.68 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5294  hypothetical protein  44.68 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0706434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4762  lysine decarboxylase family protein  44.68 
 
 
192 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00134266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  46.93 
 
 
198 aa  164  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5162  decarboxylase family protein  44.68 
 
 
192 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26844e-44 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  41.14 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  52.94 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  48.72 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  48.41 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  44.63 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  49.02 
 
 
184 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  52.9 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>