287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2688 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  72.05 
 
 
161 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  73.29 
 
 
161 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  66.01 
 
 
157 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  57.05 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  68.67 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  62.16 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  68 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  64.94 
 
 
156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  58.44 
 
 
158 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  54.55 
 
 
158 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  50.33 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  49.02 
 
 
161 aa  169  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  49.67 
 
 
161 aa  169  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  51.95 
 
 
159 aa  160  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  48.68 
 
 
159 aa  147  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  44.37 
 
 
159 aa  145  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  44.81 
 
 
163 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  42.48 
 
 
159 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  40.52 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  43.48 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  41.22 
 
 
156 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  42.03 
 
 
147 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  42.75 
 
 
147 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  42.75 
 
 
147 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  36.42 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  42.03 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  36.54 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  38.46 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  35.19 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  35.19 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  38.51 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  35.19 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  35.95 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  35.95 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  35.95 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.29 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  36.18 
 
 
155 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  35.86 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.87 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.19 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  36.91 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  34.21 
 
 
161 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  34.78 
 
 
163 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 
155 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 
155 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
146 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  35.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  35.66 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  35.53 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  38.96 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  35.1 
 
 
155 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  35.66 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  35.66 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  35.33 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  35.33 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  34.48 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  36 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 
155 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 
156 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  34.97 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  34.97 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  34.97 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  34.97 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  35.9 
 
 
166 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 
155 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  31.58 
 
 
157 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  34.97 
 
 
146 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  35 
 
 
162 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  34.21 
 
 
165 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  34.27 
 
 
146 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  34.18 
 
 
165 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  34.62 
 
 
166 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  36.49 
 
 
156 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  34 
 
 
157 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  33.33 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  33.55 
 
 
156 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  35.62 
 
 
166 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 
158 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  34.46 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  34 
 
 
175 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  37.76 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>