More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2659 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  100 
 
 
348 aa  713  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  2.88065e-08 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  83.62 
 
 
348 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  83.62 
 
 
348 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  83.62 
 
 
348 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  77.87 
 
 
348 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  77.3 
 
 
348 aa  548  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  75 
 
 
348 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  72.7 
 
 
348 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  70.4 
 
 
347 aa  467  1e-130  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53353e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  67.05 
 
 
349 aa  454  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80069e-08 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  66.76 
 
 
349 aa  452  1e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  66.76 
 
 
349 aa  452  1e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  67.05 
 
 
349 aa  454  1e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  67.05 
 
 
349 aa  454  1e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40347e-14 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  66.76 
 
 
349 aa  452  1e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  3.87336e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  67.05 
 
 
349 aa  454  1e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  67.05 
 
 
349 aa  454  1e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  65.62 
 
 
348 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37079e-13 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  65.62 
 
 
348 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17623e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  65.62 
 
 
348 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  65.62 
 
 
348 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  65.33 
 
 
348 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.383e-07 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  54.67 
 
 
353 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  55.81 
 
 
353 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.39e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  56.94 
 
 
353 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.8636e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  55.81 
 
 
347 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  54.42 
 
 
349 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  52.16 
 
 
343 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.80746e-07  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  54.76 
 
 
337 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.82338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  54.96 
 
 
353 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  53.45 
 
 
349 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  51.61 
 
 
337 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.73214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  49.71 
 
 
336 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  51.45 
 
 
343 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  52.74 
 
 
342 aa  357  1e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.59076e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  54.47 
 
 
343 aa  357  2e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.70796e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  52.16 
 
 
338 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.34628e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  52.16 
 
 
338 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  51.33 
 
 
340 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  51.59 
 
 
338 aa  345  7e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  53.66 
 
 
353 aa  342  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.85162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  52.05 
 
 
344 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  50.42 
 
 
365 aa  340  3e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  52.45 
 
 
340 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  51.9 
 
 
338 aa  338  1e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01356e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  51.6 
 
 
339 aa  337  2e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  54.05 
 
 
330 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.78362e-06  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  51.6 
 
 
339 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  51.3 
 
 
338 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  50.73 
 
 
339 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.62 
 
 
347 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  51.87 
 
 
338 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  50.44 
 
 
339 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  52.05 
 
 
338 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  51.87 
 
 
338 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.22492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  52.33 
 
 
342 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  49.41 
 
 
334 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  50.73 
 
 
340 aa  320  2e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  48.37 
 
 
338 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  48.29 
 
 
356 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  48.07 
 
 
338 aa  315  7e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  50.73 
 
 
341 aa  314  1e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  50.73 
 
 
341 aa  313  2e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  52.78 
 
 
335 aa  312  6e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  48.86 
 
 
340 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  49.56 
 
 
334 aa  307  2e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  49.56 
 
 
334 aa  307  2e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  49.42 
 
 
339 aa  307  2e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  52.63 
 
 
312 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  50.87 
 
 
349 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  52.63 
 
 
347 aa  299  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  46.53 
 
 
333 aa  299  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  52.3 
 
 
312 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  48.96 
 
 
325 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  50.52 
 
 
324 aa  282  6e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  56.84 
 
 
332 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  57.46 
 
 
326 aa  279  6e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  51.44 
 
 
332 aa  265  9e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  6.96502e-10 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  51.85 
 
 
216 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  50.73 
 
 
234 aa  195  8e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  46.67 
 
 
165 aa  135  1e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  34.35 
 
 
285 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  35.41 
 
 
286 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  35.41 
 
 
286 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  33.33 
 
 
286 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  33 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  31.95 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  35.32 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  34.83 
 
 
364 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.61 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  32.45 
 
 
552 aa  93.2  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 
584 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.16 
 
 
269 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  39.26 
 
 
295 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  34.46 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  33.9 
 
 
269 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.52 
 
 
640 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  32.72 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  34.55 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  33.54 
 
 
269 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>