More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2579 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  66.55 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  66.55 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  66.55 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  66.9 
 
 
284 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  64.89 
 
 
284 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  66.55 
 
 
330 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  64.89 
 
 
284 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  64.89 
 
 
284 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  66.55 
 
 
284 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  64.39 
 
 
283 aa  377  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  61.35 
 
 
284 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  61.35 
 
 
284 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  60.64 
 
 
284 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  60.99 
 
 
284 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  60.28 
 
 
284 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  60.99 
 
 
284 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  61.87 
 
 
285 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  60.99 
 
 
284 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  60.64 
 
 
284 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  60.28 
 
 
284 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  61.15 
 
 
285 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  59.86 
 
 
292 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  59.15 
 
 
286 aa  357  9e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  59.15 
 
 
292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  58.8 
 
 
286 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  57.55 
 
 
281 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  57.19 
 
 
281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  49.1 
 
 
283 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  50.35 
 
 
284 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.75 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  47.16 
 
 
284 aa  281  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.81 
 
 
284 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.1 
 
 
284 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.52 
 
 
284 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.36 
 
 
283 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.1 
 
 
284 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.29 
 
 
288 aa  255  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.91 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.16 
 
 
287 aa  251  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  46.59 
 
 
283 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.69 
 
 
323 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  45.39 
 
 
295 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  41.37 
 
 
309 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.42 
 
 
307 aa  238  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.94 
 
 
309 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  40.66 
 
 
316 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  43.86 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  40.66 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.33 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.78 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  43.51 
 
 
285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  41 
 
 
307 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  43.88 
 
 
283 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
287 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  41.9 
 
 
286 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  41.9 
 
 
286 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  42.25 
 
 
286 aa  229  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.45 
 
 
307 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.51 
 
 
313 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.19 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.51 
 
 
308 aa  225  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
285 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40 
 
 
307 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.59 
 
 
308 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.78 
 
 
330 aa  221  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.5 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  41.84 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  37.18 
 
 
281 aa  211  1e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.86 
 
 
312 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  42.18 
 
 
281 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  42.25 
 
 
286 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  42.31 
 
 
286 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  42.25 
 
 
286 aa  205  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  42.76 
 
 
286 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  42.76 
 
 
286 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1456  ketose-bisphosphate aldolase  42.25 
 
 
293 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
308 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.64 
 
 
305 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  39.84 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.18 
 
 
325 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.5 
 
 
328 aa  195  7e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  36.86 
 
 
324 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  35.9 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.55 
 
 
297 aa  194  1e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>