89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2578 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  100 
 
 		 388 aa  800    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  47.41 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  43.98 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  43.98 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  43.46 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  43.46 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  44.59 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  39.9 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  37.44 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.11 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  37.69 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  42.78 
 
 		 384 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  40 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  39.05 
 
 		 384 aa  285  7e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  43.85 
 
 		 388 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  43.85 
 
 		 388 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  39.85 
 
 		 388 aa  281  9e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  41.69 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  41.69 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  41.69 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  43.59 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  41.42 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  41.42 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  41.42 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  41.42 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  41.14 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  35.17 
 
 		 377 aa  260  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  41.92 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  36.46 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  38.77 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  36.94 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  33.96 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.23 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  25.59 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  25.17 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.38 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0557  glutamine amidotransferase class-II  21.51 
 
 		 595 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0217715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.71 
 
 		 610 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.45 
 
 		 610 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.76 
 
 		 608 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.53 
 
 		 608 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0284  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  20.56 
 
 		 598 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.86 
 
 		 608 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1558  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  20.83 
 
 		 598 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.996427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4326  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.9 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.46 
 
 		 353 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  24.72 
 
 		 329 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4695  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.22 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  23.71 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  20.56 
 
 		 598 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4553  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 		 608 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.46 
 
 		 608 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  22.96 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2057  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.55 
 
 		 608 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776595  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  22.19 
 
 		 309 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5508  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.7 
 
 		 608 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0425  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  20.88 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.77 
 
 		 608 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.86 
 
 		 613 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4843  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.65 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.02 
 
 		 617 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1709  sugar isomerase (SIS)  27.34 
 
 		 305 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2686  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.55 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.02 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1706  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.48 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.48 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.48 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.48 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.3 
 
 		 612 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.3 
 
 		 612 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.62 
 
 		 609 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  23.88 
 
 		 611 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1478  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.17 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.47 
 
 		 610 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.13 
 
 		 608 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2017  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.95 
 
 		 603 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.851837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.19 
 
 		 608 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2415  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.99 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0062  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.32 
 
 		 612 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2367  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.29 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.192922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.8 
 
 		 611 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0010  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.64 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.675928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.68 
 
 		 606 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.23 
 
 		 609 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2883  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.57 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 		 611 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>