More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2461 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  79.75 
 
 		 484 aa  819    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  79.75 
 
 		 484 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  79.96 
 
 		 484 aa  821    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.96 
 
 		 484 aa  821    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  79.75 
 
 		 484 aa  819    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  79.55 
 
 		 484 aa  819    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  80.17 
 
 		 484 aa  822    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 484 aa  1009    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  79.96 
 
 		 484 aa  821    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  32.71 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 520 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  31.91 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  31.25 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  29.76 
 
 		 527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 		 516 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.3 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  30.26 
 
 		 532 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.87 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  28.64 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  28.6 
 
 		 525 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  28.6 
 
 		 525 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  28.34 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  28.6 
 
 		 525 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  28.07 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 		 516 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.47 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  27.84 
 
 		 513 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.87 
 
 		 579 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  28.86 
 
 		 586 aa  173  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  27.87 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  29.62 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  27.79 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  28.34 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  27.73 
 
 		 529 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  29.19 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.02 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.26 
 
 		 531 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.25 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.29 
 
 		 534 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  26.98 
 
 		 584 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  29.5 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  26.87 
 
 		 538 aa  150  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 		 552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  26.41 
 
 		 545 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  25.77 
 
 		 563 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  26.77 
 
 		 531 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.68 
 
 		 564 aa  142  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.05 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  25.12 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  26.65 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  26.29 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  24.73 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  25.52 
 
 		 583 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.46 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.82 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.83 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  25.78 
 
 		 465 aa  123  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  25.34 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  24.55 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.77 
 
 		 466 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.06 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  24.14 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.97 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  24.67 
 
 		 474 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 		 474 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.55 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  26.77 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.85 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.5 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  26.33 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 		 536 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  23.69 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  23.94 
 
 		 534 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.55 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  24.04 
 
 		 478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  25.28 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.32 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  24.7 
 
 		 472 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.77 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  23.27 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  24.69 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.72 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.16 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.37 
 
 		 656 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  23.89 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.88 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  25.5 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>