250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2454 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  60.95 
 
 		 688 aa  840    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  52.12 
 
 		 687 aa  692    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  53.93 
 
 		 676 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  54.03 
 
 		 745 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  60.06 
 
 		 719 aa  827    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  54.34 
 
 		 749 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  56.71 
 
 		 710 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  60.74 
 
 		 688 aa  834    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  53.88 
 
 		 710 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  53.88 
 
 		 713 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  53.78 
 
 		 676 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  60.95 
 
 		 688 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  54.34 
 
 		 753 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  60.47 
 
 		 688 aa  843    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  52.66 
 
 		 698 aa  694    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  54.49 
 
 		 710 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  69.36 
 
 		 681 aa  1007    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  50 
 
 		 724 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  54.49 
 
 		 710 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  56.13 
 
 		 726 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  54.34 
 
 		 749 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 684 aa  1419    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  53.42 
 
 		 709 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  59.83 
 
 		 723 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  69.15 
 
 		 686 aa  1008    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  54.49 
 
 		 710 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  53.42 
 
 		 687 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  54.03 
 
 		 745 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  52.5 
 
 		 725 aa  693    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  69.65 
 
 		 681 aa  1010    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  54.03 
 
 		 745 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  69.87 
 
 		 669 aa  972    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  54.19 
 
 		 745 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  46.6 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  38.92 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.94 
 
 		 661 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  38.31 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  38.55 
 
 		 663 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  38.51 
 
 		 662 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 		 668 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.89 
 
 		 668 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  35.73 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  35.84 
 
 		 667 aa  389  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 672 aa  280  7e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.12 
 
 		 695 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 		 665 aa  247  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 699 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 697 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 760 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 681 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 702 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25 
 
 		 699 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 702 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 768 aa  147  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 702 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 668 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 661 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 673 aa  125  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 793 aa  104  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 775 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 684 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 716 aa  95.5  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 685 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 750 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 766 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 751 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 751 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 735 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 725 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  39.83 
 
 		 185 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 780 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.62 
 
 		 775 aa  78.2  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.59 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 693 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 713 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 721 aa  72.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 724 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.42 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 698 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 713 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 742 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 694 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 776 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.19 
 
 		 596 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 718 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>