More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2373 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  64.97 
 
 		 231 aa  274  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  42.13 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  37.77 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.71 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  26.59 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>