More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2247 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  100 
 
 		 327 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  89.02 
 
 		 328 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  92.72 
 
 		 349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  92.41 
 
 		 349 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  92.72 
 
 		 349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  88.11 
 
 		 328 aa  577  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  86.93 
 
 		 328 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  90.52 
 
 		 326 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  87.8 
 
 		 328 aa  557  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  87.8 
 
 		 328 aa  557  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  87.8 
 
 		 328 aa  557  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  87.8 
 
 		 329 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  87.8 
 
 		 328 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  87.8 
 
 		 328 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  87.5 
 
 		 328 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  87.8 
 
 		 328 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  87.8 
 
 		 329 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  86.89 
 
 		 328 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  64.31 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  63.34 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  60.87 
 
 		 322 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  59.87 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  58.28 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  58.28 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  57.42 
 
 		 315 aa  338  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  57.24 
 
 		 338 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  57.89 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  57.57 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  58.14 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  56.41 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  56.09 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  56.25 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  56.58 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  53.55 
 
 		 334 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  51.57 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  51.72 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  52.58 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  51.4 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  51.4 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  58.47 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  52.19 
 
 		 339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  51.77 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  51.77 
 
 		 335 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  56.44 
 
 		 317 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0047  L-arabinose transporter permease protein  51.77 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  52.35 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2600  L-arabinose transporter permease protein  52.79 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3010  L-arabinose transporter permease protein  53.44 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  41.18 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.85 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.85 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.85 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.11 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  43.11 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  41.55 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.93 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  40 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.17 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.81 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.54 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.12 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  39.79 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.98 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.74 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>