86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2207 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  84.81 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  84.81 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  68.35 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  67.09 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  67.09 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  67.09 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  67.09 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  65.82 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  65.82 
 
 		 79 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  64.56 
 
 		 79 aa  105  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  66.13 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  66.13 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  66.13 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  69.09 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  64.52 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  60.27 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  64.52 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  69.09 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  58.9 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  57.33 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  58.9 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  58.9 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  66.13 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  62.9 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  62.5 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  56.67 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  48 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  45.57 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  52.31 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  47.22 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  59.18 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  53.23 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  45.33 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  54.9 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  45.83 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2562  hypothetical protein  86.84 
 
 		 38 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  58 
 
 		 50 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.07 
 
 		 250 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  48.84 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  48.98 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  46 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  38.98 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  46.51 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  46.51 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  37.88 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  36.23 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  46.51 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  44.19 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  38.98 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.64 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  46.51 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  38 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  36.51 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  46.51 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  39.62 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44.19 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  38.6 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  39.58 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  34.55 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  39.53 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  35.29 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  39.58 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>