62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2160 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  67.48 
 
 
128 aa  168  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  67.48 
 
 
128 aa  168  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  67.48 
 
 
128 aa  168  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  50.39 
 
 
130 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  52.8 
 
 
130 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  48.84 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  51.61 
 
 
132 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  45.74 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  42.4 
 
 
127 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  46.4 
 
 
145 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  44.88 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  43.08 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  45.74 
 
 
137 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  37.21 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  37.21 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  35.59 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  35.59 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  35.59 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  34.26 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  33.88 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.62 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  32.43 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  32.52 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  33.02 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  40.28 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  43.24 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  31.86 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  31.86 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  31.86 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  31.86 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  30.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  30.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  30.97 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  35.4 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.04 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  28.95 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  29.91 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  29.91 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.17 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  32.17 
 
 
123 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  32.43 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0765  putative small multi-drug resistant family protein  32.46 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>