152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2139 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2139  serine transporter  100 
 
 		 427 aa  854    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41295  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2939  serine transporter  50.82 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.557142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1339  serine transporter  50.82 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1630  serine transporter  50.82 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.80045  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1242  serine transporter  50.35 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0363509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2666  serine transporter  50.59 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.973532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2656  serine transporter  49.3 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1550  serine transporter  49.3 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2739  serine transporter  49.3 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2269  hypothetical protein  49.51 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3293  serine transporter family protein  49.17 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.412902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3249  serine transporter  49.88 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416009  normal  0.367748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3113  serine transporter family protein  49.17 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3178  serine transporter family protein  49.17 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.509174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3130  serine transporter family protein  49.17 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805755  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3193  serine transporter family protein  49.17 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2241  hypothetical protein  49.27 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02641  predicted serine transporter  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0892  serine transporter  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0919  serine transporter  50.49 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02603  hypothetical protein  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2940  serine transporter family protein  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.271081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3101  serine transporter family protein  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.41481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2936  serine transporter family protein  48.94 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0834253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3076  serine transporter family protein  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.119779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4060  serine transporter family protein  48.71 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0916  serine transporter  48.7 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3396  aromatic amino acid permease  50 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2397  putative serine transporter  46.5 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2804  amino acid transporter transmembrane  49.03 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2183  aromatic amino acid permease  48.8 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2327  aromatic amino acid permease  48.19 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3589  aromatic amino acid ABC transporter permease  48.56 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3633  threonine/serine transporter  47.71 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3149  putative serine transporter  46.4 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1760  threonine/serine transporter  46.38 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001600  serine transporter  45.59 
 
 		 418 aa  348  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05580  hypothetical protein  45.17 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2772  amino acid transporter, transmembrane  43.33 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1262  serine transporter  46.35 
 
 		 417 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.040396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0739  aromatic amino acid permease  41.93 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3365  serine transporter, putative  40.75 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3302  spore germination protein  41.61 
 
 		 409 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0863  aromatic amino acid permease  40.43 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0765  aromatic amino acid permease  41.81 
 
 		 431 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3483  aromatic amino acid permease  41.81 
 
 		 431 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3262  amino acid transporter, transmembrane  40.8 
 
 		 430 aa  328  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3552  aromatic amino acid permease  41.81 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3674  aromatic amino acid permease  41.81 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0761  amino acid transporter, transmembrane  40.8 
 
 		 430 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0919  serine transporter, putative  40.57 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0858  aromatic amino acid permease  40.24 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0861  aromatic amino acid permease  41.08 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02693  predicted transporter  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4114  serine transporter family protein  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0845  serine transporter  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2992  serine transporter family protein  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000482525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3167  serine transporter family protein  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02656  hypothetical protein  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0870  serine transporter  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2993  serine transporter family protein  41.36 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.07384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3015  serine transporter family protein  41.22 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0771  aromatic amino acid permease  39.81 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3240  inner membrane transport protein YqeG  40.98 
 
 		 409 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3356  inner membrane transport protein YqeG  40.98 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3175  inner membrane transport protein YqeG  40.98 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3254  inner membrane transport protein YqeG  40.98 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0329788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3191  inner membrane transport protein YqeG  40.83 
 
 		 409 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3066  serine/threonine transporter family protein  38.59 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3306  serine/threonine transporter family protein  38.59 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3286  serine/threonine transporter family protein  39.13 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3106  serine transporter  39.28 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3146  aromatic amino acid permease  39.86 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3416  serine transporter  39.28 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365375  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5569  aromatic amino acid permease  39.37 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.179015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3427  serine/threonine transporter family protein  39.04 
 
 		 439 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1840  serine/threonine transporter family protein  38.8 
 
 		 439 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.781271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3407  serine/threonine transporter family protein  38.8 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3198  serine/threonine transporter family protein  39.04 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0885914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3451  serine/threonine transporter family protein  39.04 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.305913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2127  serine transporter, putative  38.53 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3207  serine/threonine transporter family protein  38.93 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2484  serine/threonine transporter family protein  38.65 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3415  serine/threonine transporter family protein  38.8 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3177  serine transporter  38.8 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1797  serine transporter  43.2 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003156  serine transporter  41.06 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524012  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1616  serine transporter  42.96 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.973383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1344  serine transporter  40.1 
 
 		 416 aa  299  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0919  serine transporter  40.82 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110337  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0423  serine transporter  38.31 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01909  hypothetical protein  40.1 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3505  threonine/serine transporter TdcC  36.94 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3538  threonine/serine transporter TdcC  36.94 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.457036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3431  threonine/serine transporter TdcC  36.94 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3434  threonine/serine transporter TdcC  36.94 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3601  threonine/serine transporter TdcC  36.94 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0688  aromatic amino acid permease  38.8 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0882  serine transporter  35.51 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3241  threonine/serine transporter TdcC  36.77 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>