33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2107 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2107  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.464561  hitchhiker  0.00280428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2673  spore coat U domain-containing protein  46.98 
 
 
329 aa  234  1e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.463214  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1661  spore coat U domain-containing protein  46.98 
 
 
329 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1773  spore coat U domain-containing protein  46.98 
 
 
329 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  41.22 
 
 
315 aa  216  3e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  40.88 
 
 
315 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2820  Spore coat U domain protein  35.22 
 
 
336 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  37.39 
 
 
313 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  37.39 
 
 
321 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  37.39 
 
 
321 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  37.39 
 
 
321 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  37.39 
 
 
321 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  37.39 
 
 
321 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  37.39 
 
 
321 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  35.92 
 
 
321 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  35.51 
 
 
337 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  37.77 
 
 
323 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  35.33 
 
 
323 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  31.64 
 
 
323 aa  133  4e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3668  spore coat U  37.77 
 
 
323 aa  131  1e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.28 
 
 
323 aa  126  4e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  29.36 
 
 
323 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  33.77 
 
 
324 aa  115  8e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  29.26 
 
 
321 aa  110  2e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34.25 
 
 
325 aa  63.2  5e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.89 
 
 
156 aa  63.2  5e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  32.65 
 
 
168 aa  57  4e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  26.71 
 
 
173 aa  52.8  8e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  29.5 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  25.5 
 
 
167 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  29.1 
 
 
165 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  33.33 
 
 
175 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>