More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2050 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  741    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  76.14 
 
 
389 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  77.45 
 
 
369 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  77.01 
 
 
406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  53.89 
 
 
352 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  53.27 
 
 
352 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  47.55 
 
 
384 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  49.57 
 
 
352 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  48.57 
 
 
353 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  45.66 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  49.13 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  45.35 
 
 
356 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  48.86 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  46.65 
 
 
360 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  48.86 
 
 
350 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  48.29 
 
 
355 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  48.86 
 
 
353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  46.91 
 
 
356 aa  319  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  48 
 
 
355 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  45.11 
 
 
387 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  49.13 
 
 
352 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  47.22 
 
 
394 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  47.68 
 
 
361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  50.46 
 
 
352 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  45.48 
 
 
371 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  50.15 
 
 
352 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  50.15 
 
 
374 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  46.18 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  48.31 
 
 
354 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  50.29 
 
 
353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  47.41 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  47.31 
 
 
350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  46.08 
 
 
354 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  46.08 
 
 
354 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  48 
 
 
354 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  46.69 
 
 
381 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  45.78 
 
 
354 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  46.39 
 
 
352 aa  299  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  45.18 
 
 
354 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  45.04 
 
 
355 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  41.52 
 
 
346 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  45.07 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  45.18 
 
 
363 aa  278  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  40 
 
 
358 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  46.6 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  45.6 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  39.94 
 
 
347 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  43.64 
 
 
372 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  43.64 
 
 
352 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  44.61 
 
 
359 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  43.49 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  40.22 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  35.54 
 
 
363 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 
363 aa  185  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  33.14 
 
 
359 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  34.44 
 
 
362 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  31.51 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  37.46 
 
 
356 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  34.18 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  32.46 
 
 
398 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  34.26 
 
 
357 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  29.85 
 
 
358 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
339 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  31.16 
 
 
361 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  31.58 
 
 
361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  28.89 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.87 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  34.88 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.14 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.89 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 
370 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  30.11 
 
 
361 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  31.41 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  28.66 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.75 
 
 
367 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  27 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  28.81 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  25.94 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.89 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  28.01 
 
 
388 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 
346 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  26.49 
 
 
368 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  30.23 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  29.15 
 
 
399 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.65 
 
 
362 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 
423 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 
339 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  28.94 
 
 
397 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 
345 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  28.97 
 
 
504 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  26.17 
 
 
372 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  24.33 
 
 
355 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  27.68 
 
 
352 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 
363 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>