78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1969 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  41.13 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  39.72 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  41.38 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  41.38 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  40.69 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  41.38 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  40.69 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  39.01 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  40 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  40.69 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  38.19 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  36.36 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  34.97 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  30.71 
 
 		 189 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  34.48 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  32.85 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  32.85 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  31.47 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  30.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  30.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  23.78 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  29.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  25 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  25.35 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  25.35 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  25.35 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  25.35 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  25.35 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  27.86 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  24.65 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  24.29 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  25.17 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  21.99 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  24.34 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  24.66 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  24.83 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  26.76 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  26.76 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  24.16 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  25.97 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  25.97 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  25.17 
 
 		 294 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  24.36 
 
 		 146 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>