More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1966 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.74 
 
 
271 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.74 
 
 
271 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.74 
 
 
271 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.74 
 
 
271 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.74 
 
 
271 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.37 
 
 
271 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.08912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 
271 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.37 
 
 
271 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  69.37 
 
 
271 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.37 
 
 
271 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  69.37 
 
 
271 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  69.37 
 
 
271 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.34725e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.37 
 
 
271 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69.37 
 
 
271 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 
271 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  68.27 
 
 
271 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  68.63 
 
 
271 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  68.63 
 
 
271 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14817e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.9 
 
 
271 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  7.28433e-09  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.16 
 
 
271 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.53 
 
 
271 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.74258e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.42 
 
 
271 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.16 
 
 
271 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  58.67 
 
 
269 aa  337  2e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  58.3 
 
 
269 aa  333  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  59.04 
 
 
269 aa  324  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  58.53 
 
 
271 aa  320  2e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  58.53 
 
 
271 aa  318  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0427  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  63.1 
 
 
275 aa  315  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  58.63 
 
 
272 aa  314  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  58.63 
 
 
272 aa  314  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  58.63 
 
 
272 aa  313  2e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  58.63 
 
 
272 aa  313  2e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  58.63 
 
 
272 aa  313  2e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  58.63 
 
 
272 aa  312  3e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  58.63 
 
 
272 aa  311  5e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  58.63 
 
 
272 aa  311  5e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  56.04 
 
 
271 aa  311  9e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  57.83 
 
 
272 aa  308  7e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3984  YaeC family lipoprotein  58.82 
 
 
270 aa  308  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  59.26 
 
 
270 aa  306  2e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  57.03 
 
 
266 aa  303  3e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  52.17 
 
 
276 aa  276  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  50.92 
 
 
271 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  50.92 
 
 
271 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  50.18 
 
 
271 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  50.18 
 
 
271 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  50.18 
 
 
271 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  50.18 
 
 
271 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  51.19 
 
 
281 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.58 
 
 
267 aa  244  1e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.19 
 
 
272 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  47.58 
 
 
267 aa  244  1e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.19 
 
 
272 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.19 
 
 
272 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.19 
 
 
272 aa  244  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.19 
 
 
272 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  49.08 
 
 
271 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.79 
 
 
272 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.79 
 
 
272 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  46.3 
 
 
264 aa  239  3e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  51.93 
 
 
262 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  48.89 
 
 
270 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.15 
 
 
270 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  50.2 
 
 
270 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  47.17 
 
 
266 aa  235  5e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  51.53 
 
 
270 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  48.33 
 
 
271 aa  234  1e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  47.39 
 
 
275 aa  234  1e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  8.12987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  50.83 
 
 
268 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  8.1124e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  50.21 
 
 
260 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  46.41 
 
 
286 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  48.76 
 
 
262 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  50 
 
 
268 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  8.95864e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50 
 
 
268 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  49.58 
 
 
529 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  49.24 
 
 
281 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.52 
 
 
258 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.52 
 
 
258 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  46.94 
 
 
264 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  47.62 
 
 
272 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  47.28 
 
 
259 aa  221  1e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  50.87 
 
 
268 aa  221  1e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  50.87 
 
 
268 aa  221  1e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  47.56 
 
 
268 aa  220  2e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  47.73 
 
 
266 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  47.73 
 
 
266 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  50.43 
 
 
268 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  50 
 
 
268 aa  219  4e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  49.13 
 
 
268 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  49.13 
 
 
268 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  42.86 
 
 
278 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  47.11 
 
 
258 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  44.36 
 
 
297 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  41.54 
 
 
259 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  45.82 
 
 
278 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  52.21 
 
 
260 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  48.95 
 
 
265 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  49.2 
 
 
265 aa  214  1e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>