More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1916 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 
434 aa  858    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  70.82 
 
 
439 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  66.19 
 
 
439 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  66.04 
 
 
432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  69.23 
 
 
445 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  65.73 
 
 
442 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  62.88 
 
 
433 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  61.06 
 
 
436 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  61.06 
 
 
436 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  61.06 
 
 
436 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  65.51 
 
 
441 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  60.82 
 
 
435 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  60.24 
 
 
438 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  59.48 
 
 
441 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
431 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
449 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  62.18 
 
 
449 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
437 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
437 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
437 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
437 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  63.81 
 
 
437 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.02 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.84 
 
 
430 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.99 
 
 
439 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  49.65 
 
 
442 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.87 
 
 
420 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  51.28 
 
 
412 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  51.79 
 
 
412 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  52.05 
 
 
409 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  52.05 
 
 
409 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  50.26 
 
 
392 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  50.26 
 
 
392 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  49.87 
 
 
411 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  50.26 
 
 
392 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  50.26 
 
 
392 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  50.26 
 
 
413 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  48.76 
 
 
412 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 
412 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  48.76 
 
 
412 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  48.76 
 
 
412 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.23 
 
 
412 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  49.23 
 
 
412 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  49.23 
 
 
412 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  49.23 
 
 
412 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  49.23 
 
 
412 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  49.23 
 
 
412 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  46.06 
 
 
431 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 
412 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  47.89 
 
 
423 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  47.52 
 
 
434 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  46.06 
 
 
431 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  49.36 
 
 
410 aa  363  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  44.26 
 
 
431 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  44.26 
 
 
431 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  45.81 
 
 
431 aa  358  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  49.87 
 
 
411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  45.85 
 
 
431 aa  355  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.76 
 
 
433 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  46.31 
 
 
431 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  46.06 
 
 
431 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  46.06 
 
 
431 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  45.81 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  44.69 
 
 
432 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  45.81 
 
 
431 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.91 
 
 
450 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.27 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  43.7 
 
 
426 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  42.65 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.59 
 
 
448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  46.25 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  44.72 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  44.33 
 
 
453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  44.53 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  40.84 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  44.77 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  43.32 
 
 
418 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.95 
 
 
444 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  44.12 
 
 
442 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  42.95 
 
 
451 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.95 
 
 
444 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  42.5 
 
 
456 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  43.16 
 
 
622 aa  296  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.73 
 
 
463 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  44.23 
 
 
442 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  41.09 
 
 
456 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.67 
 
 
448 aa  292  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  44.59 
 
 
439 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  43.7 
 
 
464 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  43.26 
 
 
429 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  40.25 
 
 
447 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  41.73 
 
 
435 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  40.63 
 
 
462 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  44.94 
 
 
442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  41.85 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  41.85 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  41.85 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  41.85 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  41.85 
 
 
437 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  36.88 
 
 
450 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>