212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1915 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  65.93 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  58.74 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  62.59 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  51.33 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1686  manganese transport regulator MntR  59.42 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  51.05 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  51.47 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  52.11 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  52.94 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  50.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  53.38 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  54.76 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  54.76 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  48.94 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  48.94 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  48.94 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  48.94 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  48.94 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  51.39 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  51.39 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  54.33 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.44 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  52.67 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  54.76 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  47.4 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  48.51 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  52.38 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  45.39 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  44.68 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  33.61 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.87 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  29.93 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  38.39 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  34.48 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  34.23 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.76 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  35.04 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.93 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  34.75 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.93 
 
 		 126 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  32.43 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  29.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  34.4 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.58 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  33.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  31.53 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.64 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.54 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  29.46 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  32.38 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  29.51 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  34.19 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  34.19 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  34.19 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  34.21 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.58 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  32.08 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  26.79 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.25 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  38.1 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.65 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  28.67 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  32.38 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.48 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  35.65 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  32.38 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  33 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.82 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  30.28 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  35.48 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  29.81 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  34.51 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>