140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1801 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  63.43 
 
 
361 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  63.71 
 
 
361 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  63.43 
 
 
361 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  63.43 
 
 
361 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  51.23 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  38.22 
 
 
349 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  37.16 
 
 
374 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  36.51 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  26.81 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  26.81 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  31.56 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  31.56 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  29.35 
 
 
338 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  37.31 
 
 
362 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  37.31 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  30.85 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  27.8 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.06 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  27.62 
 
 
317 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.8 
 
 
332 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  23.87 
 
 
332 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  27.42 
 
 
338 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  27.09 
 
 
338 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.3 
 
 
343 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.23 
 
 
344 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  27.44 
 
 
338 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  27.48 
 
 
356 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.8 
 
 
337 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  26.42 
 
 
356 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  23.23 
 
 
332 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  27.16 
 
 
356 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  24.49 
 
 
335 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  26.06 
 
 
337 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  26.1 
 
 
328 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  25.59 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  26.8 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  28.57 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  23.55 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  26.39 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  27.23 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  27.73 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  25.16 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  36.28 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  36.28 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  66.67 
 
 
791 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  25.44 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.49 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  26.13 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  28.83 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  25.09 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  25.62 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  22.97 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  25.16 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  28.21 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  33.04 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  23.57 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  24.21 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  24.83 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  23.62 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  22.76 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  23.48 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  25.93 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  23.85 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  24.37 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  22.7 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  25.52 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  25.52 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.96 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  22.76 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  22.76 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  22.76 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  25.25 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.91 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  24.52 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.4 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  29.02 
 
 
330 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  29.51 
 
 
456 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  23.69 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  29.51 
 
 
492 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  22.57 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  29.51 
 
 
492 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  29.51 
 
 
492 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  29.51 
 
 
481 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  29.51 
 
 
492 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.43 
 
 
349 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  29.51 
 
 
488 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.35 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  25.33 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.42 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  21.91 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  25.42 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  29.38 
 
 
363 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  23.17 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  21.91 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  23.79 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  23.79 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  23.79 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>