More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1750 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
175 aa  362  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  52.44 
 
 
172 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  53.46 
 
 
168 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  51.59 
 
 
209 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  54.19 
 
 
161 aa  177  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  49.69 
 
 
168 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  53.21 
 
 
193 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  50.3 
 
 
168 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  49.38 
 
 
177 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  51.35 
 
 
177 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
171 aa  157  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  44 
 
 
157 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  47.86 
 
 
147 aa  134  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 
158 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
150 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 
159 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  41.14 
 
 
160 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  47.58 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  42.47 
 
 
150 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
179 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
153 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.41 
 
 
157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
155 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.38 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  37.34 
 
 
186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  47.9 
 
 
147 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  47.9 
 
 
147 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 
147 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  39.73 
 
 
157 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
160 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  40.41 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.57 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 
149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  34.64 
 
 
290 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  42.25 
 
 
212 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  38.41 
 
 
158 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
149 aa  111  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  44.88 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  46.02 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  46.02 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
147 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  46.02 
 
 
268 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 
147 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  46.72 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  43.26 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  43.26 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 
168 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4816  putative transcriptional regulator  40.56 
 
 
165 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  43.55 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  44.72 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  43.55 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.76 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
164 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  43.9 
 
 
146 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
280 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
152 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
135 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2125  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
160 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.5635  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  45.53 
 
 
163 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  45.53 
 
 
163 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  42.52 
 
 
183 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  40.14 
 
 
165 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  45.69 
 
 
147 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
156 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  43.2 
 
 
161 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  45.04 
 
 
150 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>