28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1723 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2721  chromosome segregation and condensation protein MukF  86.82 
 
 		 440 aa  797    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2049  condesin subunit F  84.81 
 
 		 441 aa  760    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1777  condesin subunit F  86.39 
 
 		 441 aa  772    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.041681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2301  condesin subunit F  87.27 
 
 		 440 aa  803    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00933  hypothetical protein  86.82 
 
 		 440 aa  797    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00336906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2200  condesin subunit F  86.36 
 
 		 440 aa  794    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1083  condesin subunit F  86.82 
 
 		 440 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000724748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1057  condesin subunit F  87.5 
 
 		 440 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.886679  normal  0.0551551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0998  condesin subunit F  87.5 
 
 		 440 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0762943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1106  condesin subunit F  87.5 
 
 		 440 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1090  condesin subunit F  87.5 
 
 		 440 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.199303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1025  condesin subunit F  87.5 
 
 		 440 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.252995  normal  0.616117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2402  condesin subunit F  86.82 
 
 		 440 aa  796    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000536027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2198  condesin subunit F  86.82 
 
 		 440 aa  797    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000709701  normal  0.0963487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2674  condesin subunit F  86.59 
 
 		 440 aa  795    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000312627  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2657  condesin subunit F  91.36 
 
 		 440 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.533281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1969  condesin subunit F  91.36 
 
 		 440 aa  835    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1723  condesin subunit F  100 
 
 		 440 aa  899    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.721184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1021  condesin subunit F  86.82 
 
 		 440 aa  797    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000478423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1029  condesin subunit F  86.59 
 
 		 440 aa  796    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000114842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2567  condesin subunit F  91.36 
 
 		 440 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1441  condesin subunit F  87.27 
 
 		 440 aa  801    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00926  condesin subunit F  86.82 
 
 		 440 aa  797    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00351613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0864  condesin subunit F  64.77 
 
 		 440 aa  591  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0729  condesin subunit F  62.92 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00740317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01587  condesin subunit F  62.02 
 
 		 445 aa  578  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1319  condesin subunit F  62.25 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000193264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003936  chromosome partition protein MukF  61.57 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000070452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>