More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1722 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  100 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  79.69 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  79.69 
 
 
261 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  79.31 
 
 
261 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  69.35 
 
 
261 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  70.5 
 
 
261 aa  387  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  68.58 
 
 
261 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  70.47 
 
 
278 aa  380  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  63.6 
 
 
261 aa  358  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  65.35 
 
 
267 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  65.35 
 
 
267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  65.35 
 
 
267 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  65.35 
 
 
267 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  65.35 
 
 
267 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  63.92 
 
 
258 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  48.45 
 
 
263 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  50 
 
 
260 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  48.67 
 
 
271 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  48.06 
 
 
263 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  47.66 
 
 
259 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  44.44 
 
 
254 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  42.23 
 
 
262 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  42.23 
 
 
262 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  41.57 
 
 
257 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  40.77 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  41.57 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  41.43 
 
 
261 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  42.58 
 
 
256 aa  218  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
257 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  40.87 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  40.23 
 
 
284 aa  207  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  38.91 
 
 
259 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
249 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  41.83 
 
 
252 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  42.63 
 
 
249 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  37.8 
 
 
247 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  41.77 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  41.73 
 
 
249 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  42.63 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  42.63 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
249 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  42.4 
 
 
249 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  40.15 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  41.04 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  38.91 
 
 
268 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
295 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  36.26 
 
 
262 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.09 
 
 
295 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
252 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  37.96 
 
 
221 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  38.33 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  28.94 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  32.23 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  28.11 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  29.67 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  27.62 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  26.01 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  27.02 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  32.08 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.93 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
337 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.74 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.95 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.04 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
457 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  24.64 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.56 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.85 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.29 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.28 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>