107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1578 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  50.9 
 
 		 611 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  58.74 
 
 		 618 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  100 
 
 		 611 aa  1241    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  58.74 
 
 		 618 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  58.74 
 
 		 618 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  51.71 
 
 		 611 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  49.03 
 
 		 615 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  47.82 
 
 		 617 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  47.82 
 
 		 617 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  47.5 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  47.66 
 
 		 617 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  47.5 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  47.5 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  47.5 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  47.66 
 
 		 617 aa  591  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  48.06 
 
 		 618 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  48.06 
 
 		 618 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  47.5 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  47.9 
 
 		 618 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  47.9 
 
 		 618 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  47.9 
 
 		 618 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  46.6 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  48.07 
 
 		 604 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.82 
 
 		 695 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.98 
 
 		 695 aa  170  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.27 
 
 		 703 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  22.01 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  22.39 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  22.63 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.72 
 
 		 614 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  21.04 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.13 
 
 		 612 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  21.7 
 
 		 607 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  23.48 
 
 		 719 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.46 
 
 		 812 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  21.37 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  21.37 
 
 		 607 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  21.27 
 
 		 606 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  21.06 
 
 		 606 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  21.86 
 
 		 607 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.09 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  21.11 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  20.98 
 
 		 614 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21 
 
 		 696 aa  107  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.37 
 
 		 640 aa  101  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.75 
 
 		 747 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  21.7 
 
 		 712 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  20.51 
 
 		 640 aa  98.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.75 
 
 		 748 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.11 
 
 		 748 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.26 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25 
 
 		 797 aa  90.9  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.48 
 
 		 748 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.55 
 
 		 741 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  22.37 
 
 		 748 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  22.42 
 
 		 699 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.57 
 
 		 741 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  22.75 
 
 		 893 aa  88.2  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.88 
 
 		 740 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  23.71 
 
 		 794 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.89 
 
 		 732 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  20.6 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  22.05 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  20.96 
 
 		 655 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.69 
 
 		 741 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  21.78 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  21.04 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  18.96 
 
 		 602 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  20.2 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  22.38 
 
 		 826 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  21.6 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  20.58 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  20.14 
 
 		 705 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  22.09 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  21.68 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  18.37 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.64 
 
 		 789 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  21.56 
 
 		 1013 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  20.86 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  21.36 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  20 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  19.77 
 
 		 656 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  21.98 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.12 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.54 
 
 		 762 aa  57  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  25.93 
 
 		 839 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  24.14 
 
 		 660 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  23.77 
 
 		 895 aa  53.9  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25 
 
 		 660 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  30.51 
 
 		 675 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  22.81 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.37 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  24.69 
 
 		 832 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.37 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  28.97 
 
 		 711 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  18.8 
 
 		 1070 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  20.93 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  19.83 
 
 		 611 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  21.05 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  19.64 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>