52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1540 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1540  AAA ATPase  100 
 
 		 778 aa  1603    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000740195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1481  HAT helix repeat-containing RNA-processing protein  24.89 
 
 		 981 aa  71.2  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00406892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 1034 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2137  hypothetical protein  21.88 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  27.6 
 
 		 1049 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.09 
 
 		 996 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.87 
 
 		 957 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 798 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  26.8 
 
 		 916 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  27.67 
 
 		 1227 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1112  NB-ARC domain-containing protein  26.61 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.07 
 
 		 1092 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  25.31 
 
 		 824 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.49 
 
 		 792 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  33.59 
 
 		 1209 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.67 
 
 		 1104 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  31.15 
 
 		 514 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  27.84 
 
 		 1186 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  26.42 
 
 		 1076 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 973 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  26.35 
 
 		 1110 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 1043 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  26.71 
 
 		 1125 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 1014 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  27.46 
 
 		 566 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 329 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 906 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.45 
 
 		 795 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  25.73 
 
 		 1010 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 950 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 973 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 973 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 952 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  26.32 
 
 		 975 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 928 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  28.42 
 
 		 961 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 1079 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 922 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  25.66 
 
 		 1085 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 605 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  28.48 
 
 		 1064 aa  45.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.31 
 
 		 1100 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.65 
 
 		 1228 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 1093 aa  44.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 502 aa  45.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.14 
 
 		 1030 aa  44.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  25 
 
 		 760 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  24.85 
 
 		 1056 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 		 784 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 818 aa  44.3  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  25.16 
 
 		 1072 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>