228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1469 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  76.81 
 
 
209 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  74.4 
 
 
209 aa  338  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  76.81 
 
 
208 aa  337  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  75.85 
 
 
209 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  75.85 
 
 
209 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  75.85 
 
 
209 aa  337  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  75.36 
 
 
209 aa  337  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  75.36 
 
 
209 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  75.73 
 
 
210 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  76.33 
 
 
208 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  75.85 
 
 
208 aa  334  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  75.36 
 
 
209 aa  327  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  74.27 
 
 
207 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  68.66 
 
 
205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  64.68 
 
 
208 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  65.17 
 
 
202 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  63.9 
 
 
209 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  64.18 
 
 
206 aa  262  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  62.25 
 
 
230 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  61.84 
 
 
207 aa  260  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  61.72 
 
 
209 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  60.87 
 
 
207 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  63.24 
 
 
209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  64.04 
 
 
201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  58.17 
 
 
207 aa  257  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  63.55 
 
 
201 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  60.77 
 
 
208 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  60.77 
 
 
221 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  63.55 
 
 
201 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  61.19 
 
 
205 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.87 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  63.55 
 
 
201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  60.7 
 
 
205 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  59.33 
 
 
208 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  59.33 
 
 
208 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  61.76 
 
 
206 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  59.7 
 
 
205 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  58.85 
 
 
208 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  58.71 
 
 
206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  56.86 
 
 
210 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  57.97 
 
 
207 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  56.31 
 
 
218 aa  238  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  55.12 
 
 
205 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  52.71 
 
 
208 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  58.62 
 
 
209 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  54.15 
 
 
205 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  55.61 
 
 
203 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  54.07 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  52.97 
 
 
221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  49.28 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  53.85 
 
 
202 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  49.75 
 
 
202 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  63.64 
 
 
140 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  46.11 
 
 
208 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  48.02 
 
 
201 aa  177  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.02 
 
 
201 aa  177  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  47 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  49.17 
 
 
203 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.72 
 
 
209 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  46.96 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  44.5 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.45 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  45.69 
 
 
209 aa  160  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  46.41 
 
 
203 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  48.63 
 
 
212 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  44.02 
 
 
201 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.72 
 
 
203 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  41.09 
 
 
201 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  43.2 
 
 
203 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  46.03 
 
 
201 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  42.59 
 
 
230 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  42.59 
 
 
230 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  45.6 
 
 
194 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  45.05 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  45.05 
 
 
194 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  41.9 
 
 
241 aa  145  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  41.67 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  44.25 
 
 
209 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  37.56 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  41.01 
 
 
220 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  34.69 
 
 
204 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.7 
 
 
219 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  37.11 
 
 
291 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  35 
 
 
292 aa  118  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.87 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  40.41 
 
 
216 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.47 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.43 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  39.6 
 
 
228 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.71 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.92 
 
 
199 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.1 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.65 
 
 
201 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  32.46 
 
 
203 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1494  hypothetical protein  48.15 
 
 
124 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.368034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>