More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1461 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  70.27 
 
 		 716 aa  1051    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  73.1 
 
 		 699 aa  1076    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  70.27 
 
 		 716 aa  1051    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.71 
 
 		 714 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.41 
 
 		 716 aa  1053    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.81 
 
 		 715 aa  1040    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.86 
 
 		 714 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.14 
 
 		 716 aa  1046    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  66.99 
 
 		 725 aa  1001    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 732 aa  1509    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  70.27 
 
 		 716 aa  1051    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  71.29 
 
 		 701 aa  1052    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.86 
 
 		 714 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.27 
 
 		 716 aa  1050    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.13 
 
 		 726 aa  1263    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  73.39 
 
 		 699 aa  1078    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.27 
 
 		 716 aa  1050    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.86 
 
 		 714 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.13 
 
 		 726 aa  1263    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.41 
 
 		 716 aa  1053    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.14 
 
 		 762 aa  1049    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.57 
 
 		 714 aa  1038    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.13 
 
 		 726 aa  1263    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.29 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.78 
 
 		 703 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.22 
 
 		 692 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.04 
 
 		 690 aa  357  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.6 
 
 		 690 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.6 
 
 		 690 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.6 
 
 		 690 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.3 
 
 		 707 aa  356  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.43 
 
 		 690 aa  356  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.6 
 
 		 690 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.75 
 
 		 690 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.83 
 
 		 691 aa  353  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.29 
 
 		 690 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.65 
 
 		 691 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.29 
 
 		 690 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.85 
 
 		 690 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.71 
 
 		 692 aa  350  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.9 
 
 		 691 aa  344  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.43 
 
 		 690 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 711 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  32.34 
 
 		 691 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 691 aa  342  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.83 
 
 		 720 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.6 
 
 		 708 aa  339  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.23 
 
 		 721 aa  337  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.67 
 
 		 686 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.34 
 
 		 716 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  32.82 
 
 		 750 aa  315  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.87 
 
 		 714 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 		 714 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.44 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 714 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.83 
 
 		 725 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 		 700 aa  310  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.1 
 
 		 714 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.92 
 
 		 710 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  32.53 
 
 		 714 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.53 
 
 		 714 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.6 
 
 		 714 aa  300  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.62 
 
 		 714 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.91 
 
 		 714 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.91 
 
 		 714 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.86 
 
 		 714 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.02 
 
 		 738 aa  293  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.05 
 
 		 758 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.05 
 
 		 729 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.8 
 
 		 741 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.38 
 
 		 692 aa  284  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  28.55 
 
 		 664 aa  257  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.82 
 
 		 832 aa  221  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.79 
 
 		 929 aa  210  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  26.78 
 
 		 822 aa  208  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  29.34 
 
 		 659 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.61 
 
 		 952 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.31 
 
 		 934 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.79 
 
 		 927 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  28.85 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.74 
 
 		 934 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.74 
 
 		 934 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  28.97 
 
 		 631 aa  197  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  27.93 
 
 		 662 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  29.69 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  29.69 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.89 
 
 		 934 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  29.69 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  29.69 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  28.66 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  29.69 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  29.69 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  29.69 
 
 		 636 aa  196  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.05 
 
 		 929 aa  194  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.75 
 
 		 934 aa  193  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.86 
 
 		 934 aa  193  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.83 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.91 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  29.55 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.83 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>