More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1443 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  67.21 
 
 		 514 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  80 
 
 		 496 aa  738    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  68.92 
 
 		 499 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  100 
 
 		 493 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  54.51 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  54.51 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  53.76 
 
 		 475 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  54.08 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  51.36 
 
 		 489 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  51.38 
 
 		 489 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  51.17 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  51.38 
 
 		 489 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 478 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  29.46 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 478 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 471 aa  177  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 507 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  27.68 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.23 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  29.81 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  32.56 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.16 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  28.54 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.82 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 423 aa  115  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.96 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 451 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  27.8 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  28.11 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.29 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  29.18 
 
 		 460 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 474 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  28.6 
 
 		 499 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.77 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  27.17 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  27.17 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 480 aa  107  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.62 
 
 		 455 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.27 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.35 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.13 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.81 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.28 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.25 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.23 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.6 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  29.35 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 457 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.7 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.47 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  26.5 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  26.77 
 
 		 450 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 478 aa  97.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  27.9 
 
 		 452 aa  97.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 478 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.66 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  30.25 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  26.43 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  25 
 
 		 447 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  24.63 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  26.12 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  26.48 
 
 		 446 aa  94  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.97 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  26.44 
 
 		 473 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  26.54 
 
 		 475 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>