More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1357 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  697    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  55.03 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 342 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 639 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 659 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 630 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 630 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 648 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 604 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 604 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 604 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 604 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  73.02 
 
 		 63 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  29.3 
 
 		 253 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 253 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 254 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 254 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  28.84 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 		 253 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  28.04 
 
 		 251 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  28.69 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 252 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  27.98 
 
 		 278 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  30.45 
 
 		 251 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  47.12 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  37.59 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  28.79 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.61 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  30.22 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  31.84 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  43.01 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  29.55 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  34.17 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.17 
 
 		 132 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  25.2 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  28.71 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.05 
 
 		 135 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  33.05 
 
 		 137 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.93 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  24.8 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.17 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.17 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>