36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1230 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2956  outer membrane porin  74.84 
 
 		 468 aa  730    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00243761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00629  hypothetical protein  75.05 
 
 		 468 aa  732    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0734  outer membrane porin, OprD family  74.63 
 
 		 468 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.897732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0843  outer membrane porin, OprD family  74.63 
 
 		 468 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0807  OprD family outer membrane porin  74.63 
 
 		 468 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0746  outer membrane porin, OprD family  74.63 
 
 		 468 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0569  outer membrane porin, OprD family  74.84 
 
 		 468 aa  731    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000403252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0703  OprD family outer membrane porin  74.63 
 
 		 468 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000220662  normal  0.949628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2975  outer membrane porin  75.05 
 
 		 468 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2993  outer membrane porin  69.23 
 
 		 473 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0325  OprD family outer membrane porin  69.23 
 
 		 473 aa  678    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038295  normal  0.923743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1230  outer membrane porin  100 
 
 		 467 aa  960    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033366  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0709  porin D  74.84 
 
 		 468 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000316757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0728  OprD family outer membrane porin  75.05 
 
 		 468 aa  732    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00197385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2905  OprD family outer membrane porin  69.23 
 
 		 473 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0155537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00638  predicted outer membrane porin  75.05 
 
 		 468 aa  732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1196  outer membrane porin  75.16 
 
 		 465 aa  730    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000266112  decreased coverage  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1391  outer membrane porin  40 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01313  hypothetical protein  32.97 
 
 		 461 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004152  N-acetylglucosamine-regulated outer membrane porin  29.67 
 
 		 469 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.569888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  24.28 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  24.1 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  23.99 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  22.52 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  22.48 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  23.12 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  23.51 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  22.15 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  22.44 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  22.68 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  23.9 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  22.48 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  24.52 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  22.25 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  22.9 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  21.93 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>