More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1192 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  100 
 
 
127 aa  246  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  68.6 
 
 
127 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  68.6 
 
 
127 aa  175  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  68.6 
 
 
127 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  166  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  165  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  165  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  165  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  165  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  69.17 
 
 
127 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  70 
 
 
127 aa  165  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  70 
 
 
127 aa  165  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  69.17 
 
 
127 aa  164  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  69.17 
 
 
127 aa  164  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  69.17 
 
 
127 aa  164  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  63.2 
 
 
127 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  61.6 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  54.33 
 
 
127 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  54.4 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  63.2 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  61.42 
 
 
127 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  54.39 
 
 
125 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 
126 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  53.21 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 
128 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 
128 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
137 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  53.21 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  47.11 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  50 
 
 
129 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  48.67 
 
 
147 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  49.11 
 
 
146 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  46.09 
 
 
154 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  47.75 
 
 
128 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  51.4 
 
 
128 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 
126 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 
126 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  51.55 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 
126 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  51.55 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  52.63 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
125 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 
122 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  46.79 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  43.97 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.66 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.82 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40.16 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  42.74 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.51 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.14 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  43.3 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  43.52 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>