More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1191 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  51.89 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  49.18 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  48.63 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  35.51 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.53 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  29.71 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  29.71 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  29.71 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  29.71 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  29.71 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  29.71 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  29.63 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.71 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 125 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  36.76 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>