More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1123 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  69.86 
 
 		 292 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  69.52 
 
 		 292 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  69.18 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  67.81 
 
 		 292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  60.96 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  59.29 
 
 		 298 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  59.19 
 
 		 298 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  59.56 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  59.79 
 
 		 299 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  58.76 
 
 		 299 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  57.88 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  57.74 
 
 		 306 aa  308  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  48.98 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  48 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  49.08 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  45.87 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  44.41 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  48.06 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  48 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  48.35 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  45.99 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  46.34 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  43.77 
 
 		 303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  48.12 
 
 		 321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  43.97 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  43.93 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  44.73 
 
 		 313 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  46.42 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  44.61 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  44.61 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  45.35 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.46 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  47.39 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  43.24 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  46.13 
 
 		 339 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  46.13 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  42.12 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  40.59 
 
 		 311 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  45.23 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  42.86 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  41.67 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  32.89 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.69 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 353 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  34.71 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 311 aa  175  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.21 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  34.3 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.39 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  31.71 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  32.49 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.02 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.02 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.87 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  32.59 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 315 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  35.44 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.85 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.19 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  29.63 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  30.82 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  29.77 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  30.74 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  28.82 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  29.59 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  29.55 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.43 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  26.99 
 
 		 345 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>