More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1108 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  80.78 
 
 		 593 aa  949    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  80.78 
 
 		 593 aa  950    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  80.78 
 
 		 593 aa  950    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 		 592 aa  1196    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  83.3 
 
 		 607 aa  950    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  80.78 
 
 		 593 aa  950    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.93 
 
 		 593 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.05 
 
 		 591 aa  944    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  83.3 
 
 		 607 aa  950    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  80.78 
 
 		 593 aa  949    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.76 
 
 		 593 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  80.78 
 
 		 593 aa  950    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3040  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  83.3 
 
 		 607 aa  951    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.636426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.23 
 
 		 597 aa  899    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.26 
 
 		 594 aa  890    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  80.78 
 
 		 593 aa  949    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  80.1 
 
 		 593 aa  957    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.93 
 
 		 593 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  80.61 
 
 		 593 aa  947    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.89 
 
 		 593 aa  944    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  76.83 
 
 		 601 aa  941    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.93 
 
 		 593 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  49.4 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  48.54 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  40.62 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  43.28 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  39.69 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  39.48 
 
 		 587 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.9 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  40.07 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.07 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 587 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.07 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  40.41 
 
 		 587 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.9 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.36 
 
 		 579 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.63 
 
 		 581 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 		 622 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  39.68 
 
 		 677 aa  345  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  38.08 
 
 		 666 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 666 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 666 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.54 
 
 		 666 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.78 
 
 		 600 aa  342  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.35 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.35 
 
 		 666 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  31.43 
 
 		 599 aa  329  7e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.16 
 
 		 597 aa  327  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  31.06 
 
 		 578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  35.96 
 
 		 666 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  32.87 
 
 		 594 aa  321  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  33.85 
 
 		 602 aa  319  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.67 
 
 		 611 aa  319  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.95 
 
 		 604 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  34.96 
 
 		 592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  32.59 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  35.64 
 
 		 650 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  30.46 
 
 		 680 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.05 
 
 		 599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  32.87 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  33.33 
 
 		 665 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  32.68 
 
 		 625 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 		 608 aa  298  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.95 
 
 		 610 aa  296  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  33.39 
 
 		 672 aa  296  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  31.19 
 
 		 691 aa  296  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  31.02 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  32.53 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.24 
 
 		 617 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  30.77 
 
 		 631 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.87 
 
 		 607 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  30.76 
 
 		 614 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  32.4 
 
 		 645 aa  293  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.8 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.84 
 
 		 600 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  33.04 
 
 		 585 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.79 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  33.21 
 
 		 663 aa  290  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  32.2 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.05 
 
 		 597 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.8 
 
 		 608 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  32.89 
 
 		 613 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.05 
 
 		 702 aa  289  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  33.45 
 
 		 603 aa  289  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  30.82 
 
 		 627 aa  289  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.89 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.24 
 
 		 611 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.06 
 
 		 677 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  30.77 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.74 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.71 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  32.79 
 
 		 635 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.54 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.3 
 
 		 617 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.54 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>