139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0980 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  64.92 
 
 
190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  58.64 
 
 
189 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  58.64 
 
 
189 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  58.64 
 
 
189 aa  238  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  58.64 
 
 
189 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.87 
 
 
192 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  58.12 
 
 
189 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  57.59 
 
 
189 aa  234  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  57.07 
 
 
189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  59.28 
 
 
194 aa  225  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.73 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  48.48 
 
 
205 aa  190  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  48.95 
 
 
208 aa  187  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  47.47 
 
 
202 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  45.26 
 
 
195 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  45.13 
 
 
199 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.26 
 
 
194 aa  177  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  45.74 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  45.74 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.07 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.39 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.07 
 
 
193 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  44.68 
 
 
194 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  45.21 
 
 
196 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  45.31 
 
 
197 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  43.81 
 
 
204 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
189 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  43.55 
 
 
194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.01 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  44.15 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  42.55 
 
 
192 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.25 
 
 
195 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  40.41 
 
 
194 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.93 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  42.93 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  42.93 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
198 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.68 
 
 
197 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  34.74 
 
 
177 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.68 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.91 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  31.67 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  35.83 
 
 
176 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.89 
 
 
180 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  34.41 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.7 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
176 aa  88.6  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.84 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  31.75 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  31.49 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.64 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  40.22 
 
 
118 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.84 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  29.41 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  31.4 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.63 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  28.8 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  30.48 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.37 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  26.84 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.64 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  28.49 
 
 
177 aa  62.4  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.43 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
181 aa  62  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  26.47 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.21 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  29.3 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.75 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  27.54 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  28.31 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.76 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  28 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.41 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.37 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  26.38 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.86 
 
 
164 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.41 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  30.83 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.11 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.11 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  29.5 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.54 
 
 
123 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.45 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  27.08 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.86 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  27.08 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.76 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  27.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>